南京市重点专科，设有肾脏内科病房，肾脏科高危病房，血液净化中心，肾脏内科门诊，中心实验室；现有享受国务院津贴专家2名，副主任医师2名，主治医师3名；博士研究生3名，硕士研究生7名；在研课题7项，包括2项国自然，1项省自然；发表SCI论文及核心期刊论文20余篇；独立开展双膜血浆置换，免疫吸附，血浆滤过吸附等多种血液净化技术，开展甲状旁腺切除术+前臂种植、甲状旁腺超声微波消融术，彩超或DSA引导下球囊扩张血管成形术、疑难复杂内瘘建立、人工血管动静脉内瘘建立、肾活检及肾脏病理等特色技术。

肠瘘与腹腔感染中心站在现代普通外科发展的前沿，以营养支持为基础，肠康复治疗为特色，针对肠瘘与腹腔感染、创伤、炎性肠病、短肠综合征、放射性肠损伤、重症胰腺炎等肠功能障碍性疾病开展了积极而有效的诊治与预防工作，在出血、感染、营养不良和多脏器功能支持障碍等治疗方面积累了丰富的经验。

耳鼻咽喉头颈外科为医院特色科室，拥有一支临床、教学与研究经验丰富的两岸医疗团队和独立病区，科室下设4个专业亚科：耳科、鼻科、咽喉科、头颈外科,拥有台湾专科医生1人，主任医师2人，副主任医师7人,主治医师2人,住院医师3人，其中硕士及以上学历8人。

胰腺中心系南京医科大学第一附属医院胰腺中心分中心，国际知名胰腺外科专家苗毅教授工作站所在地，由苗毅教授、蒋奎荣教授团队高水平管理。目前是江苏省第二大胰腺中心，年胰腺手术>300台，年住院>4000人次。中心汇集了国内最大的“一站式实时全程多学科胰腺疾病团队“，囊括外科、内镜、ICU、内科、麻醉、化疗、护理、病理、放射介入等专业，集医教研一体，构建国内一流的胰腺疾病诊治平台，秉承“专业、规范、学术、品质、卓越”的宗旨，以国际化管理与人性化服务为特色为

心血管内科建设成功国家胸痛中心，建立了以互联网为载体的24小时会诊平台和一整套健全的健康教育及救治体系。辐射周边100公里以内的二级、一级医院及社区医院，以一种新的模式——卫星胸痛中心或网格化的胸痛中心进行运作。

南京医科大学附属东南亚雏鸡仙踪林与武汉亚洲心脏病医院合作共建明基-亚心联合心脏外科。科室拥有一支以全国知名专家、心外科“金刀奖”、国之名医获得者陶凉教授为学科带头人，实力强劲的心外科专业队伍，成熟开展冠心病、瓣膜病、先天性心脏病、大血管病等各类心脏疾病的外科手术。科室开放床位60张，拥有先进的手术室和术后监护室（ICU），配有国际先进的麻醉机、体外循环机、主动脉球囊反搏仪、血滤机、体外生命支持仪（ECMO）等各类心脏专业设备，为患者提供高效安全的术前术后诊疗支持。

科室拥有较先进的手术设备，包括手术显微镜、神经内镜、开颅动力系统等；监护室设备完善包括监护系统、呼吸机、颅内压监测仪等；并利用医院先进的检查设备包括MRI、CT、DSA等，创造了为患者提供优质的服务和良好治疗结果的必要基础。

个体化治疗、精准医疗、微创手术和加速康复。微创手术涵盖各亚专科，包括微创关节置换、运动损伤及骨折关节镜手术，腰椎间盘突出和椎管狭窄等下腰椎病变3D-Viewer辅助手术、脊柱椎间孔镜等，骨折微创手术（各种经皮固定、显微外科修复），关节镜治疗软骨损伤等。